中国教育工会上海中医药大学委员会在校党委的领导和上级工会的指导下，紧紧依靠广大全校教职工，在围绕中心，服务大局，突出维护，加强内涵，提升工作水平方面作了一些探索和努力，取得了比较显著的成绩。我校以校务公开民主管理为抓手，制定了一系列的制度，切实维护教职工的民主政治权利；加强教职工队伍素质教育，维护教职工的发展权和精神文化权益；以“帮困送温暖”、“休息休养”等保障工作为重点，维护教职工的经济利益；有健全的组织体系，不断完善工会自身建设。2013年被全国总工会授予“全国模范职工之家”称号。

中国教育工会上海中医药大学委员会目前有工会会员1318名，部门工会27个，专职工会干部4名。工会下设有上海中医药大学青年教师联谊会（成立于1994年）和女教授女医师联谊会（成立于1989年）。各类教职工社团有篮球、足球、排球、乒乓球、羽毛球、瑜伽、拉丁舞、健身气功、棋牌、钓鱼、京剧、摄影、多肉植物、社区服务、手工制作健康跑、龙舟等25个。

2016年6月学校召开第十三次工会会员代表大会，选举产生第十三届工会委员会和工会经费审查委员会。另设有劳动人事争议调解委员会和救急济难基金管理委员会。

工会在校党委和上级工会的指导下，深入学习党的十八大、十九大精神，贯彻落实中央加强和改进党的群团工作意见，切实履行工会的维护、建设、参与、教育基本职能，紧紧围绕学校中心工作，进一步统一思想、凝心聚力、发扬民主、锐意改革，团结带领全体教职工，为学校“高水平大学”、“双一流大学”建设贡献力量。